郭守敬纪念馆位于北二环南侧，积水潭北岸的汇通祠内。

郭守敬是元代伟大的水利专家。忽必烈时代建元大都城时，为解决都城内的供水来源问题，郭守敬开辟了通惠河，修筑了白浮堰，把昌平东南的神山、一亩诸水引入，扩大了城区高粱河的水量。此后，郭守敬又将海水东引，沿皇城东墙南流并与金朝所开的金口河下游的故道相会东流，构成了大都与通州之间的运河通惠河。

郭守敬纪念馆内有元大都时通惠河引水工程的模型。

郭守敬纪念馆所在的汇通祠是1988年在愿汇通祠遗址处重建的。原来的汇通祠是始建于明朝的文物古迹，旧称法华祠。清朝乾隆年间重修后更名为汇通祠。此祠位于河水入城之处，曾经有如潮的水声和夏荷秋叶令游人流连忘返。

1976年修建地下铁路时，为通涵洞拆毁了古建筑汇通祠。

1988年在原址处新建了仿古建筑汇通祠。